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醫療廢物有著多的傳染性、致病性的物品，故而應盛放在醫用垃圾桶里，妥善處置。然而在寵物醫院的寵物醫療垃圾卻依舊當做普通垃圾處理，這是危險的。
事實上，對寵物醫院的醫療廢物，其處理嚴格程度不亞于人類醫院的處理手段。動物診療機構產生的醫療廢棄物，攜帶大量病原微生物、寄生蟲及其他傳染性、有毒有害物質，易造成環境污染和人體健康危害，成為疫病流行源頭。因此，這些廢棄物不能隨意處置，要由正規的專業資質單位進行處理。
杭州一位傳染病疾控防疫專家說，寵物醫院醫療廢物隨手一扔，或與生活垃圾一起傾倒的后果嚴重。
“寵物醫院每天收治病貓、病犬，所使用的一次性針管、注射器以及紗布等醫療廢物，若得不到、及時處置，那么處理廢物的人就會暴露在風險中，形成公共衛生的重大風險?！?/span>
為了提高各家動物診療機構規范經營意識，紹興市還舉行了所有動物診療機構負責人培訓班，邀請浙江大學動物院小動物診療方面的專家，重點講解動物診療管理相關法律法規制度，動物診療等機構經營管理和規范化執業以及醫療廢物(廢水)規范處置等內容。業務培訓切實增強了動物診療機構主體責任意識、守法經營意識，提升動物診療行業規范化水平。
紹興市農業農村局還與生態環保、衛生健康、市場監管等多部門進行對接，建立聯動機制。與該市市場監管局聯合制定《寵物美容、用品店及診療機構守法經營告知書》，與市生態環保局建立起管理協作機制，進一步建立健全動物診療行業監管的長效機制。
